如何用Prism繪制“中斷”柱狀圖

2018/07/27
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繪制坐標軸“中斷”柱狀圖,可以用Prism軟件可以做坐標軸中斷嗎?

關于繪制坐標軸“中斷”柱狀圖,可以用Prism軟件可以做坐標軸中斷嗎?
Prism也是一款比較經典好用的科研作圖軟件,在高分文章中經常出現它的身影,如下面的例子。它是一款從原始數據分析到圖表生成“一站式”流程化的軟件,例如它可通過Raw data 自動在圖中生成誤差線(error bars),這一點非常贊!
下面就看下如何用Prism軟件作圖吧,本文所用的軟件版本為Graphpad Prism 7.0(官網:https://www.graphpad.com/)。


(PNAS,2003)


(Nature, 2016)

數據準備
打開軟件后,通過雙擊窗口灰色區域或點Prism(棱鏡)的小三角,新建工程文件,如下圖。

在彈出的向導頁面選擇表格類型,如本文用的數據與為單列數據(6次重復),選Column,enter/import data 選第1項(如下圖)。

Prism的表格中的數據組織是要求非常嚴格的,正確的數據結構是作圖成功的關鍵,初學者如果對表格結構有疑惑,可通過下面的示例數據進行比較學習(下圖虛線框所示)。

接下來將數據粘貼到表格中,類似Excel,Prism多以多列的“寬”數據為主。

表格數據填完后,圖表已基本上“完成“了,只需點左側導航欄中Graphs菜單下的Data1(與Data Tables下的表格同名),然后選擇圖表類型和誤差線類型即可看到繪制結果,見下圖。

圖表調整
不喜歡“矮胖“的柱狀圖,可以設置圖表的比例尺寸,方法如下圖。

為縱軸添加“中斷“也很簡單,切換到Left Y axis 選項卡,在Gaps and Direction下拉列表中選擇中斷類型,并設置上下兩段(Segment)坐標軸的范圍,方法見下圖。

如果不喜歡黑白的圖,可以通過Change菜單或Change Colors按鈕對表標的進行的自定義顏色調整,Prism也內建許多模板,可以選擇自己喜歡的樣式(見下圖),如這里選的 Winter soft 樣式。

圖表導出
通過File \ Export Graph 導出所需格式的圖片,如下圖。

比較方便的是,通過File\ Send to Word (或PowerPoint)可直接將圖表導出到Word (見下圖)和PPT中。

參考文獻
[1] Santos R A S, e Silva A C S, Maric C, etal. Angiotensin-(1–7) is an endogenous ligand for the G protein-coupledreceptor Mas[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2003,100(14): 8258-8263./
[2] Manglik A, Lin H, Aryal D K, et al.Structure-based discovery of opioid analgesics with reduced side effects[J].Nature, 2016, 537(7619): 185.


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