《單細胞測序完全解析》新書上市!

2020/08/20
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都2020年了,你還以為單細胞測序很貴,離你很遠嗎?

在互聯網時代,傳輸速度的提升往往帶來革命性的變化(如4G到5G),10x genomics這類型的技術出現,使萬級別的單細胞群體研究成為成本可接受的事情,這就是一種革命性的變化。

作為目前最火的技術,單細胞測序正在滲透到各個研究領域,以10x genomics技術為代表,從2017年開始,單細胞相關的文章正在經歷著高速增長。

單細胞組學研究是一個新興的研究方向。這個方向無論在實驗技術還是分析技術上,都在飛速發展。如果要把握單細胞這一新興方向的機會,就要求科研人員不斷學習,不斷提高。

作為最像出版社的測序公司,“出書”已是基迪奧的特色之一。在撰寫上一本《基因表達調控——新組學技術介紹與應用》的時候,我們還只是將單細胞組學作為并列值得關注的幾個組學新技術之一。但沒有想到,短短一年內單細胞研究大熱,成為組學研究領域的“明星”。我們意識到,單細胞組學是一個獨立于常規組學技術(如RNA-seq、ATAC-seq等常規組學技術),自成體系的研究方向,完全值得單獨出一本書。

與常規組學技術比較,單細胞組學研究至少有以下特點

  1. 包含多種組學,自成體系:類似常規組學,單細胞組學技術同樣包含RNA-seq、ATAC-seq、DNA-seq等不同組學技術。
  2. 分析更加復雜:因為任何組學到了單細胞的精度,數據的規模和復雜程度將至少擴大三四個數量級。因此單細胞組學將使用到常規組學極少用到的復雜算法以及多樣化的分析思路。
  3. 樣本準備要求更高:要啟動單細胞測序,在獲得目標組織的基礎上,還涉及制備單細胞懸液、富集目標細胞等,因此對樣本前期處理也有極高的要求。

內容簡介

本書內容涵蓋了從實驗設計、樣本準備到生物信息分析等單細胞組學的方方面面。

  • 在第一章,我們概述了單細胞組學領域的發展情況。
  • 在第二~五章則介紹了單細胞RNA-seq、單細胞ATAC-seq和單細胞免疫組測序的原理、分析方法和應用思路。
  • 第六章介紹了另外一種類似單細胞的新技術——空間轉錄組。
  • 第七~八章則針對單細胞測序的樣本制備方法和生物信息流程進行專門的解析。

具體目錄如下:

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